減量では体脂肪を落とす事が目的。
増量では筋肉を増やす事を目的としす。

増量期には、前提として消費カロリーよりも多くのカロリーを摂取する必要があります。そうして体は筋肉を大きくするためにエネルギーを使います。
増量期でたくさん食べて、トレーニングすべきですが、このタイミングで筋肉だけ増やすのは難しく、カロリーがオーバーするため、どうしても脂肪が増えます。
例えば、増量期に筋トレと食事を増やし、体重が5kg増えたとします。
しかし、その内訳は
筋肉が3kg
脂肪が2kg増加している…

あくまでイメージこうした事が体で起こってます。

しかし、このまま筋肉と一緒に脂肪も増えれば、理想的な体には近づけません。
そこで増量期で増えてしまった分の脂肪を｢減量期｣で減らします。
その際、増量期に脂肪が増えてしまった様に減量期では脂肪と共に、どうしても筋肉も落ちてしまいます。

ただし
この減量期で筋肉が2kg、脂肪が2kg落ちたとすると結果的に筋肉が1kg増えたことになります。

3歩進んで2歩下がるですが、長い目で見ると筋肉量の底上げと、体脂肪を減らすことが出来ます。